Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK11BP21127 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK11BP21127 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK11BP21127 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK11BP21127 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK11BP21127 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms