Protein–RNA interactions for Protein: P19784

CSNK2A2, Casein kinase II subunit alpha', humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A2P19784 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK2A2P19784 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK2A2P19784 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A2P19784 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A2P19784 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms