Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCAP17252 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCAP17252 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCAP17252 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms