Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNT1P13805 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNT1P13805 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNT1P13805 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNT1P13805 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNT1P13805 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms