Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS3P13797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLS3P13797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLS3P13797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLS3P13797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLS3P13797 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLS3P13797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLS3P13797 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLS3P13797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLS3P13797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLS3P13797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLS3P13797 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLS3P13797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLS3P13797 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLS3P13797 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLS3P13797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLS3P13797 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLS3P13797 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLS3P13797 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLS3P13797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLS3P13797 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PLS3P13797 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLS3P13797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLS3P13797 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLS3P13797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLS3P13797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLS3P13797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLS3P13797 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLS3P13797 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLS3P13797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLS3P13797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLS3P13797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLS3P13797 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PLS3P13797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLS3P13797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLS3P13797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PLS3P13797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLS3P13797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLS3P13797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLS3P13797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLS3P13797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLS3P13797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLS3P13797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLS3P13797 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLS3P13797 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLS3P13797 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLS3P13797 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLS3P13797 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLS3P13797 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLS3P13797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLS3P13797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PLS3P13797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLS3P13797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLS3P13797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLS3P13797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLS3P13797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLS3P13797 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLS3P13797 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLS3P13797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLS3P13797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLS3P13797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLS3P13797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLS3P13797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLS3P13797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLS3P13797 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLS3P13797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLS3P13797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLS3P13797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLS3P13797 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLS3P13797 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLS3P13797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLS3P13797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLS3P13797 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLS3P13797 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLS3P13797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms