Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LCP1P13796 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCP1P13796 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCP1P13796 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LCP1P13796 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCP1P13796 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCP1P13796 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCP1P13796 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LCP1P13796 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCP1P13796 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LCP1P13796 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LCP1P13796 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCP1P13796 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LCP1P13796 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LCP1P13796 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCP1P13796 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCP1P13796 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LCP1P13796 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCP1P13796 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCP1P13796 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LCP1P13796 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCP1P13796 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCP1P13796 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCP1P13796 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCP1P13796 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCP1P13796 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCP1P13796 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCP1P13796 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCP1P13796 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCP1P13796 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCP1P13796 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCP1P13796 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LCP1P13796 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCP1P13796 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCP1P13796 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCP1P13796 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCP1P13796 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LCP1P13796 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LCP1P13796 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LCP1P13796 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCP1P13796 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCP1P13796 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LCP1P13796 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCP1P13796 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCP1P13796 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCP1P13796 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCP1P13796 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCP1P13796 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCP1P13796 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCP1P13796 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCP1P13796 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCP1P13796 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCP1P13796 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCP1P13796 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCP1P13796 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCP1P13796 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCP1P13796 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCP1P13796 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCP1P13796 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCP1P13796 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCP1P13796 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCP1P13796 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCP1P13796 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCP1P13796 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms