Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL2P13500 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL2P13500 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL2P13500 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCL2P13500 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL2P13500 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL2P13500 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL2P13500 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL2P13500 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL2P13500 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL2P13500 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL2P13500 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL2P13500 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL2P13500 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL2P13500 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL2P13500 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL2P13500 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL2P13500 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL2P13500 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL2P13500 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL2P13500 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL2P13500 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL2P13500 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL2P13500 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL2P13500 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL2P13500 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL2P13500 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL2P13500 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL2P13500 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCL2P13500 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL2P13500 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCL2P13500 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCL2P13500 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL2P13500 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCL2P13500 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL2P13500 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL2P13500 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL2P13500 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL2P13500 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCL2P13500 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCL2P13500 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL2P13500 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL2P13500 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCL2P13500 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms