Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYF5P13349 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYF5P13349 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYF5P13349 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYF5P13349 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYF5P13349 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYF5P13349 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYF5P13349 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYF5P13349 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYF5P13349 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYF5P13349 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYF5P13349 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYF5P13349 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYF5P13349 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYF5P13349 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYF5P13349 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYF5P13349 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYF5P13349 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYF5P13349 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYF5P13349 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MYF5P13349 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYF5P13349 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYF5P13349 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYF5P13349 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYF5P13349 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYF5P13349 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYF5P13349 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYF5P13349 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYF5P13349 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYF5P13349 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYF5P13349 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYF5P13349 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYF5P13349 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYF5P13349 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYF5P13349 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYF5P13349 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYF5P13349 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYF5P13349 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYF5P13349 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MYF5P13349 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYF5P13349 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYF5P13349 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYF5P13349 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYF5P13349 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYF5P13349 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYF5P13349 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYF5P13349 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYF5P13349 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYF5P13349 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYF5P13349 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYF5P13349 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms