Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP1BBP13224 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GP1BBP13224 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP1BBP13224 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms