Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT3P12035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT3P12035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT3P12035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT3P12035 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT3P12035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT3P12035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT3P12035 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT3P12035 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT3P12035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT3P12035 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT3P12035 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT3P12035 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT3P12035 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT3P12035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT3P12035 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT3P12035 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT3P12035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT3P12035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT3P12035 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT3P12035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT3P12035 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT3P12035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT3P12035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT3P12035 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT3P12035 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT3P12035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT3P12035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT3P12035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT3P12035 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT3P12035 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT3P12035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT3P12035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT3P12035 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT3P12035 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT3P12035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT3P12035 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT3P12035 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT3P12035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT3P12035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT3P12035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT3P12035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT3P12035 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT3P12035 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT3P12035 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT3P12035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT3P12035 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT3P12035 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms