Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNAP12004 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNAP12004 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNAP12004 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNAP12004 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCNAP12004 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNAP12004 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNAP12004 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNAP12004 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNAP12004 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCNAP12004 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNAP12004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCNAP12004 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNAP12004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNAP12004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNAP12004 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNAP12004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNAP12004 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNAP12004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNAP12004 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNAP12004 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNAP12004 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNAP12004 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNAP12004 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNAP12004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNAP12004 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNAP12004 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNAP12004 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNAP12004 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNAP12004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNAP12004 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNAP12004 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNAP12004 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNAP12004 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNAP12004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNAP12004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNAP12004 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNAP12004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNAP12004 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNAP12004 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNAP12004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNAP12004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNAP12004 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNAP12004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCNAP12004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCNAP12004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNAP12004 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNAP12004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNAP12004 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNAP12004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms