Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
LAMC1P11047 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LAMC1P11047 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMC1P11047 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LAMC1P11047 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LAMC1P11047 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms