Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHGAP10645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHGAP10645 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHGAP10645 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHGAP10645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHGAP10645 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHGAP10645 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CHGAP10645 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHGAP10645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHGAP10645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CHGAP10645 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHGAP10645 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHGAP10645 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHGAP10645 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHGAP10645 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHGAP10645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHGAP10645 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHGAP10645 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHGAP10645 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHGAP10645 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHGAP10645 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHGAP10645 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHGAP10645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHGAP10645 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHGAP10645 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CHGAP10645 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHGAP10645 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHGAP10645 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CHGAP10645 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHGAP10645 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CHGAP10645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CHGAP10645 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CHGAP10645 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CHGAP10645 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CHGAP10645 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHGAP10645 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CHGAP10645 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHGAP10645 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHGAP10645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHGAP10645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CHGAP10645 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHGAP10645 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHGAP10645 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHGAP10645 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CHGAP10645 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHGAP10645 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHGAP10645 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHGAP10645 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHGAP10645 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CHGAP10645 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHGAP10645 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHGAP10645 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CHGAP10645 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHGAP10645 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHGAP10645 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CHGAP10645 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CHGAP10645 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHGAP10645 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CHGAP10645 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CHGAP10645 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHGAP10645 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHGAP10645 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHGAP10645 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHGAP10645 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHGAP10645 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHGAP10645 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CHGAP10645 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHGAP10645 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHGAP10645 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHGAP10645 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHGAP10645 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHGAP10645 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHGAP10645 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHGAP10645 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHGAP10645 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHGAP10645 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHGAP10645 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHGAP10645 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHGAP10645 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHGAP10645 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHGAP10645 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHGAP10645 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHGAP10645 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHGAP10645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHGAP10645 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHGAP10645 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHGAP10645 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms