Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAR1AP10644 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKAR1AP10644 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKAR1AP10644 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAR1AP10644 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms