Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARAFP10398 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARAFP10398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARAFP10398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARAFP10398 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARAFP10398 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARAFP10398 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAFP10398 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAFP10398 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAFP10398 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAFP10398 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAFP10398 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAFP10398 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAFP10398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAFP10398 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAFP10398 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARAFP10398 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARAFP10398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARAFP10398 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARAFP10398 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARAFP10398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARAFP10398 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARAFP10398 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARAFP10398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARAFP10398 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARAFP10398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARAFP10398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARAFP10398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARAFP10398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARAFP10398 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARAFP10398 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARAFP10398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARAFP10398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARAFP10398 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARAFP10398 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARAFP10398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARAFP10398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARAFP10398 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARAFP10398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARAFP10398 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARAFP10398 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARAFP10398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARAFP10398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARAFP10398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARAFP10398 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARAFP10398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARAFP10398 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARAFP10398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARAFP10398 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARAFP10398 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARAFP10398 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARAFP10398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARAFP10398 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARAFP10398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARAFP10398 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARAFP10398 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARAFP10398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARAFP10398 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARAFP10398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARAFP10398 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARAFP10398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARAFP10398 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARAFP10398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARAFP10398 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARAFP10398 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARAFP10398 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARAFP10398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARAFP10398 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARAFP10398 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARAFP10398 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARAFP10398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms