Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT7P08729 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT7P08729 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT7P08729 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT7P08729 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT7P08729 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT7P08729 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT7P08729 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT7P08729 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT7P08729 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT7P08729 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT7P08729 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT7P08729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT7P08729 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT7P08729 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT7P08729 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT7P08729 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT7P08729 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT7P08729 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT7P08729 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT7P08729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT7P08729 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT7P08729 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT7P08729 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT7P08729 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT7P08729 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT7P08729 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT7P08729 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT7P08729 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT7P08729 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT7P08729 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT7P08729 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT7P08729 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT7P08729 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT7P08729 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT7P08729 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT7P08729 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT7P08729 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT7P08729 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT7P08729 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT7P08729 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT7P08729 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT7P08729 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT7P08729 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT7P08729 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT7P08729 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT7P08729 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT7P08729 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT7P08729 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT7P08729 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT7P08729 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT7P08729 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT7P08729 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT7P08729 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT7P08729 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT7P08729 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT7P08729 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT7P08729 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT7P08729 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT7P08729 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms