Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG5P05408 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG5P05408 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG5P05408 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG5P05408 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG5P05408 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG5P05408 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG5P05408 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG5P05408 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG5P05408 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG5P05408 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG5P05408 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG5P05408 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG5P05408 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG5P05408 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG5P05408 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG5P05408 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG5P05408 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG5P05408 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG5P05408 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCG5P05408 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG5P05408 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG5P05408 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG5P05408 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG5P05408 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG5P05408 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG5P05408 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG5P05408 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG5P05408 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG5P05408 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG5P05408 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG5P05408 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG5P05408 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG5P05408 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCG5P05408 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCG5P05408 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG5P05408 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG5P05408 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCG5P05408 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCG5P05408 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG5P05408 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG5P05408 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG5P05408 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG5P05408 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCG5P05408 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG5P05408 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCG5P05408 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG5P05408 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG5P05408 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG5P05408 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG5P05408 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCG5P05408 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG5P05408 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCG5P05408 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCG5P05408 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG5P05408 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG5P05408 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCG5P05408 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG5P05408 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCG5P05408 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCG5P05408 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCG5P05408 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCG5P05408 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms