Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPN1LWP04000 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPN1LWP04000 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OPN1LWP04000 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1LWP04000 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms