Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOEP02649 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOEP02649 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOEP02649 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOEP02649 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOEP02649 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOEP02649 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOEP02649 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOEP02649 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOEP02649 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APOEP02649 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOEP02649 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOEP02649 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOEP02649 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOEP02649 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOEP02649 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOEP02649 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOEP02649 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOEP02649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOEP02649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOEP02649 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOEP02649 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOEP02649 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOEP02649 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOEP02649 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOEP02649 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOEP02649 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOEP02649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOEP02649 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOEP02649 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOEP02649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOEP02649 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOEP02649 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOEP02649 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOEP02649 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOEP02649 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOEP02649 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOEP02649 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOEP02649 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOEP02649 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOEP02649 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOEP02649 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOEP02649 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOEP02649 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOEP02649 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOEP02649 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOEP02649 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOEP02649 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOEP02649 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOEP02649 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APOEP02649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOEP02649 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOEP02649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOEP02649 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOEP02649 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms