Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IL1AP01583 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1AP01583 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1AP01583 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1AP01583 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IL1AP01583 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL1AP01583 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1AP01583 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1AP01583 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL1AP01583 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL1AP01583 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1AP01583 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1AP01583 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1AP01583 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1AP01583 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL1AP01583 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1AP01583 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL1AP01583 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL1AP01583 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IL1AP01583 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1AP01583 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IL1AP01583 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1AP01583 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1AP01583 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1AP01583 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IL1AP01583 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1AP01583 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1AP01583 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL1AP01583 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL1AP01583 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1AP01583 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1AP01583 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1AP01583 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL1AP01583 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IL1AP01583 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1AP01583 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1AP01583 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL1AP01583 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IL1AP01583 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IL1AP01583 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1AP01583 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1AP01583 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1AP01583 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL1AP01583 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1AP01583 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1AP01583 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1AP01583 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL1AP01583 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL1AP01583 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL1AP01583 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL1AP01583 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1AP01583 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1AP01583 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1AP01583 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1AP01583 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL1AP01583 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL1AP01583 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL1AP01583 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL1AP01583 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms