Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POMCP01189 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POMCP01189 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POMCP01189 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POMCP01189 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POMCP01189 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
POMCP01189 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
POMCP01189 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POMCP01189 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POMCP01189 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POMCP01189 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POMCP01189 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POMCP01189 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POMCP01189 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POMCP01189 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POMCP01189 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POMCP01189 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POMCP01189 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POMCP01189 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POMCP01189 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POMCP01189 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POMCP01189 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POMCP01189 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POMCP01189 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POMCP01189 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POMCP01189 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POMCP01189 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POMCP01189 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POMCP01189 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POMCP01189 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POMCP01189 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POMCP01189 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POMCP01189 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POMCP01189 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POMCP01189 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POMCP01189 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POMCP01189 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POMCP01189 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
POMCP01189 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POMCP01189 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POMCP01189 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POMCP01189 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POMCP01189 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POMCP01189 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POMCP01189 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POMCP01189 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POMCP01189 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POMCP01189 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POMCP01189 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POMCP01189 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POMCP01189 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POMCP01189 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POMCP01189 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POMCP01189 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POMCP01189 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POMCP01189 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POMCP01189 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POMCP01189 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POMCP01189 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POMCP01189 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POMCP01189 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POMCP01189 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POMCP01189 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms