Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDLRP01130 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRP01130 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRP01130 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRP01130 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRP01130 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDLRP01130 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRP01130 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDLRP01130 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDLRP01130 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LDLRP01130 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDLRP01130 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LDLRP01130 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRP01130 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRP01130 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LDLRP01130 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LDLRP01130 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LDLRP01130 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRP01130 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LDLRP01130 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRP01130 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRP01130 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRP01130 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRP01130 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRP01130 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRP01130 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRP01130 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRP01130 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRP01130 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRP01130 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRP01130 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRP01130 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRP01130 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRP01130 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRP01130 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRP01130 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRP01130 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRP01130 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRP01130 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRP01130 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRP01130 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRP01130 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms