Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
APBA3O96018 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
APBA3O96018 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
APBA3O96018 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
APBA3O96018 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
APBA3O96018 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
APBA3O96018 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
APBA3O96018 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
APBA3O96018 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
APBA3O96018 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
APBA3O96018 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
APBA3O96018 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
APBA3O96018 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
APBA3O96018 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
APBA3O96018 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
APBA3O96018 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
APBA3O96018 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
APBA3O96018 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
APBA3O96018 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
APBA3O96018 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
APBA3O96018 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
APBA3O96018 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
APBA3O96018 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
APBA3O96018 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
APBA3O96018 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
APBA3O96018 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
APBA3O96018 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
APBA3O96018 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
APBA3O96018 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
APBA3O96018 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
APBA3O96018 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
APBA3O96018 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
APBA3O96018 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
APBA3O96018 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
APBA3O96018 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
APBA3O96018 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
APBA3O96018 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
APBA3O96018 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
APBA3O96018 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
APBA3O96018 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
APBA3O96018 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
APBA3O96018 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
APBA3O96018 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
APBA3O96018 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
APBA3O96018 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
APBA3O96018 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
APBA3O96018 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
APBA3O96018 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
APBA3O96018 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
APBA3O96018 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
APBA3O96018 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
APBA3O96018 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
APBA3O96018 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
APBA3O96018 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
APBA3O96018 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
APBA3O96018 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
APBA3O96018 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
APBA3O96018 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
APBA3O96018 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
APBA3O96018 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
APBA3O96018 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
APBA3O96018 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
APBA3O96018 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
APBA3O96018 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
APBA3O96018 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
APBA3O96018 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
APBA3O96018 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
APBA3O96018 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
APBA3O96018 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms