Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C6orf47O95873 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C6orf47O95873 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C6orf47O95873 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C6orf47O95873 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms