Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIC3O95833 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIC3O95833 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC3O95833 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLIC3O95833 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms