Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MATN4O95460 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MATN4O95460 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MATN4O95460 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MATN4O95460 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MATN4O95460 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN4O95460 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN4O95460 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN4O95460 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MATN4O95460 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MATN4O95460 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN4O95460 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN4O95460 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN4O95460 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN4O95460 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MATN4O95460 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MATN4O95460 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MATN4O95460 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MATN4O95460 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MATN4O95460 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MATN4O95460 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN4O95460 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MATN4O95460 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MATN4O95460 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MATN4O95460 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MATN4O95460 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MATN4O95460 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN4O95460 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN4O95460 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MATN4O95460 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MATN4O95460 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MATN4O95460 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN4O95460 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN4O95460 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN4O95460 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN4O95460 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MATN4O95460 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN4O95460 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN4O95460 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MATN4O95460 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN4O95460 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN4O95460 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN4O95460 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN4O95460 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MATN4O95460 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN4O95460 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN4O95460 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MATN4O95460 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN4O95460 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MATN4O95460 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MATN4O95460 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms