Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KIF4AO95239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIF4AO95239 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF4AO95239 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF4AO95239 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIF4AO95239 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KIF4AO95239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4AO95239 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4AO95239 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4AO95239 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KIF4AO95239 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4AO95239 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4AO95239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4AO95239 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4AO95239 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KIF4AO95239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF4AO95239 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIF4AO95239 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KIF4AO95239 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms