Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ALDH1A2O94788 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALDH1A2O94788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ALDH1A2O94788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms