Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT38O76015 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT38O76015 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT38O76015 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT38O76015 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT38O76015 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT38O76015 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT38O76015 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT38O76015 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT38O76015 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT38O76015 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT38O76015 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT38O76015 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT38O76015 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT38O76015 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT38O76015 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT38O76015 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT38O76015 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT38O76015 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT38O76015 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT38O76015 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT38O76015 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT38O76015 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT38O76015 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT38O76015 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT38O76015 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT38O76015 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT38O76015 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT38O76015 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT38O76015 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT38O76015 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT38O76015 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT38O76015 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT38O76015 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT38O76015 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT38O76015 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT38O76015 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT38O76015 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT38O76015 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT38O76015 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT38O76015 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT38O76015 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT38O76015 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT38O76015 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT38O76015 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT38O76015 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT38O76015 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT38O76015 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT38O76015 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT38O76015 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT38O76015 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT38O76015 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT38O76015 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT38O76015 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT38O76015 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT38O76015 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT38O76015 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT38O76015 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT38O76015 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT38O76015 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT38O76015 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT38O76015 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT38O76015 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT38O76015 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT38O76015 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT38O76015 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT38O76015 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms