Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCATO75600 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCATO75600 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GCATO75600 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCATO75600 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCATO75600 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCATO75600 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCATO75600 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCATO75600 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCATO75600 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCATO75600 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCATO75600 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCATO75600 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCATO75600 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GCATO75600 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCATO75600 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCATO75600 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCATO75600 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCATO75600 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCATO75600 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCATO75600 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCATO75600 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCATO75600 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCATO75600 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCATO75600 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCATO75600 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCATO75600 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCATO75600 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCATO75600 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCATO75600 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCATO75600 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCATO75600 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCATO75600 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCATO75600 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCATO75600 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCATO75600 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCATO75600 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCATO75600 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCATO75600 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCATO75600 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCATO75600 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCATO75600 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCATO75600 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCATO75600 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GCATO75600 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCATO75600 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCATO75600 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCATO75600 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCATO75600 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCATO75600 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCATO75600 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCATO75600 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCATO75600 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCATO75600 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCATO75600 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCATO75600 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms