Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPGDSO60760 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPGDSO60760 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDSO60760 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPGDSO60760 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDSO60760 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms