Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGRN1O60291 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGRN1O60291 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MGRN1O60291 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGRN1O60291 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MGRN1O60291 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGRN1O60291 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms