Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3LO60238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3LO60238 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP3LO60238 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BNIP3LO60238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP3LO60238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms