Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX1O43933 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX1O43933 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX1O43933 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PEX1O43933 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX1O43933 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX1O43933 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX1O43933 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PEX1O43933 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX1O43933 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX1O43933 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX1O43933 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX1O43933 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX1O43933 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PEX1O43933 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX1O43933 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX1O43933 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX1O43933 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX1O43933 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX1O43933 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX1O43933 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX1O43933 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX1O43933 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX1O43933 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX1O43933 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX1O43933 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX1O43933 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX1O43933 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX1O43933 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX1O43933 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX1O43933 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX1O43933 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX1O43933 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX1O43933 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX1O43933 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX1O43933 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX1O43933 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX1O43933 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX1O43933 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX1O43933 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX1O43933 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX1O43933 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX1O43933 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX1O43933 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX1O43933 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX1O43933 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX1O43933 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX1O43933 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX1O43933 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX1O43933 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX1O43933 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms