Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA2O43921 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA2O43921 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA2O43921 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA2O43921 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms