Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF1CO43896 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF1CO43896 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF1CO43896 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF1CO43896 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms