Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1GO43497 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1GO43497 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1GO43497 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA1GO43497 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1GO43497 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms