Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUPL2O15504 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUPL2O15504 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUPL2O15504 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUPL2O15504 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms