Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBDO15205 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBDO15205 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBDO15205 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBDO15205 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBDO15205 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBDO15205 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBDO15205 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBDO15205 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBDO15205 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBDO15205 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBDO15205 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBDO15205 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBDO15205 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBDO15205 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBDO15205 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBDO15205 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBDO15205 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBDO15205 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBDO15205 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBDO15205 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBDO15205 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBDO15205 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBDO15205 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBDO15205 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBDO15205 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBDO15205 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBDO15205 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBDO15205 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBDO15205 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBDO15205 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBDO15205 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBDO15205 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBDO15205 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBDO15205 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBDO15205 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBDO15205 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBDO15205 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBDO15205 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBDO15205 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBDO15205 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBDO15205 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBDO15205 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBDO15205 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBDO15205 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBDO15205 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBDO15205 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBDO15205 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBDO15205 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBDO15205 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBDO15205 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBDO15205 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBDO15205 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBDO15205 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBDO15205 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBDO15205 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBDO15205 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBDO15205 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBDO15205 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBDO15205 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBDO15205 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBDO15205 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBDO15205 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBDO15205 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBDO15205 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBDO15205 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBDO15205 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBDO15205 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms