Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC1BO15143 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARPC1BO15143 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC1BO15143 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARPC1BO15143 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1BO15143 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1BO15143 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1BO15143 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1BO15143 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1BO15143 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1BO15143 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1BO15143 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC1BO15143 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC1BO15143 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1BO15143 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms