Protein–RNA interactions for Protein: O15085

ARHGEF11, Rho guanine nucleotide exchange factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF11O15085 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ARHGEF11O15085 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ARHGEF11O15085 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ARHGEF11O15085 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ARHGEF11O15085 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ARHGEF11O15085 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
ARHGEF11O15085 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms