Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC9O14530 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC9O14530 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC9O14530 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TXNDC9O14530 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms