Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PITPNM1O00562 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PITPNM1O00562 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PITPNM1O00562 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PITPNM1O00562 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PITPNM1O00562 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PITPNM1O00562 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms