Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PES1O00541 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PES1O00541 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PES1O00541 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PES1O00541 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PES1O00541 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PES1O00541 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PES1O00541 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PES1O00541 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PES1O00541 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PES1O00541 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PES1O00541 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PES1O00541 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PES1O00541 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PES1O00541 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PES1O00541 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PES1O00541 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PES1O00541 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PES1O00541 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PES1O00541 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PES1O00541 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PES1O00541 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PES1O00541 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PES1O00541 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PES1O00541 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PES1O00541 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PES1O00541 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PES1O00541 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PES1O00541 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PES1O00541 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PES1O00541 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PES1O00541 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PES1O00541 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PES1O00541 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PES1O00541 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PES1O00541 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PES1O00541 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PES1O00541 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PES1O00541 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PES1O00541 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PES1O00541 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PES1O00541 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PES1O00541 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PES1O00541 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PES1O00541 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PES1O00541 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PES1O00541 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PES1O00541 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PES1O00541 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PES1O00541 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PES1O00541 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PES1O00541 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PES1O00541 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PES1O00541 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PES1O00541 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PES1O00541 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms