Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAD1O00515 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAD1O00515 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAD1O00515 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAD1O00515 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAD1O00515 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAD1O00515 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAD1O00515 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAD1O00515 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAD1O00515 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAD1O00515 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAD1O00515 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAD1O00515 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAD1O00515 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAD1O00515 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAD1O00515 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAD1O00515 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAD1O00515 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAD1O00515 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAD1O00515 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LAD1O00515 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAD1O00515 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAD1O00515 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LAD1O00515 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAD1O00515 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAD1O00515 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAD1O00515 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAD1O00515 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAD1O00515 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAD1O00515 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAD1O00515 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAD1O00515 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAD1O00515 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAD1O00515 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAD1O00515 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAD1O00515 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAD1O00515 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LAD1O00515 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAD1O00515 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAD1O00515 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAD1O00515 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LAD1O00515 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAD1O00515 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAD1O00515 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAD1O00515 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAD1O00515 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAD1O00515 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAD1O00515 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LAD1O00515 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LAD1O00515 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAD1O00515 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAD1O00515 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAD1O00515 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAD1O00515 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAD1O00515 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LAD1O00515 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAD1O00515 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LAD1O00515 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAD1O00515 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAD1O00515 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAD1O00515 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAD1O00515 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAD1O00515 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAD1O00515 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAD1O00515 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LAD1O00515 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAD1O00515 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAD1O00515 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAD1O00515 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAD1O00515 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAD1O00515 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LAD1O00515 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAD1O00515 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms