Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF561-AS1K7EIQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF561-AS1K7EIQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms