Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCER2I3L3R5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER2I3L3R5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER2I3L3R5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCER2I3L3R5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCER2I3L3R5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCER2I3L3R5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms