Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H3BRM9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3BRM9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3BRM9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H3BRM9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H3BRM9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H3BRM9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3BRM9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3BRM9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H3BRM9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H3BRM9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3BRM9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3BRM9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3BRM9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3BRM9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H3BRM9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H3BRM9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H3BRM9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H3BRM9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H3BRM9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H3BRM9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H3BRM9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H3BRM9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H3BRM9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H3BRM9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H3BRM9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H3BRM9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H3BRM9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H3BRM9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H3BRM9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms