Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PBE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PBE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PBE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PBE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PBE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PBE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PBE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PBE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PBE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PBE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PBE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PBE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PBE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PBE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PBE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PBE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PBE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PBE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PBE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PBE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PBE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PBE3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PBE3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PBE3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PBE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PBE3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PBE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PBE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PBE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PBE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PBE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
E9PBE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PBE3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PBE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PBE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PBE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PBE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PBE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PBE3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PBE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PBE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PBE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PBE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PBE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PBE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PBE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PBE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PBE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PBE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PBE3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PBE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PBE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PBE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PBE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PBE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PBE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PBE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms