Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B4DXG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B4DXG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DXG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DXG7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DXG7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DXG7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DXG7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DXG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DXG7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DXG7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DXG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DXG7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DXG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DXG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DXG7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DXG7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DXG7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4DXG7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4DXG7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4DXG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4DXG7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4DXG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4DXG7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4DXG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DXG7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DXG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DXG7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DXG7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DXG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DXG7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DXG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DXG7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DXG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DXG7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DXG7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DXG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DXG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DXG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DXG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DXG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DXG7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DXG7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DXG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DXG7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DXG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DXG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DXG7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DXG7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DXG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DXG7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DXG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4DXG7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DXG7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4DXG7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DXG7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DXG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DXG7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DXG7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4DXG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DXG7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DXG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
B4DXG7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms